A differenza della TAC e della Risonanza Magnetica dove vengono impiegati raggi X e onde elettromagnetiche, l'Ecografia fornisce un metodo non invasivo per valutare l'intestino.

L’ecografia delle anse intestinali riveste un ruolo rilevante nella gestione dei pazienti affetti da Malattie Infiammatorie Croniche Intestinali (MICI) come la malattia di Crohn e la rettocolite ulcerosa, poiché consente di valutare in tempo reale lo stato infiammatorio delle anse intestinali. In questi casi, l'ecografia svolge un ruolo importante nella diagnosi, nella risposta alla terapia e nell’identificazione precoce delle complicanze.

L'ecografia viene impiegata anche in età pediatrica/neonatale come per esempio nelle invaginazioni e nella stenosi ipertrofica del piloro.